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PacBio公司2015愿景:測序通量提高4倍

   2025-09-24 測序中國858
     近日,PacBio公司首席安全官Jonas Korlach在官網上發表博客表示,PacBio公司計劃提高PacBio RS II測序平臺的通量,使每SMRT cell一次運行可輸出超過4GB數據,平均讀取長度增加到15-20KB。

  去年秋天該公司升級了測序聚合酶和化學染料(P6-C4),使每SMRT cell 數據輸出量從0.5G提升到1GB,平均讀長達到10-15KB。最初的PacBio RS II平臺,一天運行16個SMRT Cell只能產生6.4G的原始數據。

  PacBio公司計劃通過提升化學試劑,操作流程及軟件來提高測序質量。包括將單一聚合酶加載到芯片上,從而提高裝載效率。

  此外,該公司計劃提升樣本制備流程并將其簡單化,為混合樣本添加條形碼,發布長插入片段和全長cDNA文庫的操作手冊。

  在數據分析方面,PacBio公司計劃與生物信息學團隊合作開發更快的de novo組裝基因組的算法,進一步開發Falcon assembler及其他軟件來解決二倍體或多倍體基因組的分析工作,簡化全長轉錄本測序、Iso-Seq™全長轉錄本/異構體測序以及人類白細胞抗原(HLA)單體型定相的工作流程。

 
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